Διατάξεις που δίνουν υπερ- αρμοδιότητες στον επικεφαλής της Γενικής Γραμματείας Δημοσίων Εσόδων περιλαμβάνει το πολυνομοσχέδιο.
Όπως χαρακτηριστικά αναφέρεται, η επιλογή των υποθέσεων που ελέγχονται κατά προτεραιότητα θα μπορεί πλέον να γίνεται με απόφαση του Γενικού Γραμματέα Δημοσίων Εσόδων με βάση κριτήρια ανάλυσης κινδύνου ή εξαιρετικά με βάση άλλα κριτήρια , τα οποία καθορίζονται από το Γενικό Γραμματέα και δεν δημοσιοποιούνται!
Ακόμη, αναφέρεται πως με απόφαση του Γενικού Γραμματέα Δημοσίων Εσόδων που εκδίδεται έως το τέλος Δεκεμβρίου κάθε έτους και μπορεί να τροποποιηθεί οποτεδήποτε, καθορίζεται ο αριθμός των μερικών ή και πλήρων ελέγχων που θα διενεργούνται εντός του επομένου έτους κατά προτεραιότητα, με βάση κριτήρια ανάλυσης κινδύνου ή εξαιρετικά με βάση άλλα κριτήρια, λαμβανομένου υπόψη του αριθμού των ελεγκτών κατά το χρόνο έκδοσης της απόφασης και του αριθμού των διενεργηθέντων ελέγχων κατά του προηγούμενους 12 μήνες.
Ειδικά για το 2016 το ανωτέρω ποσοστό ορίζεται σε 50% και για το 2017 σε 60%.
Το νομοσχέδιο τροποποιεί τις υφιστάμενες διατάξεις για την απαλλαγή από τις ποινικές ευθύνες των ελεγκτών της Γενικής Γραμματείας Δημοσίων Εσόδων, ενώ προβλέπει πως και τα όργανα της Ειδικής Γραμματείας ΣΔΟΕ , συμπεριλαμβανομένου και του Ειδικού Γραμματέα ΣΔΟΕ, δεν υπέχουν αστική ή πειθαρχική ή ποινική ευθύνη για τυχόν παρέλευση του χρόνου παραγραφής του δικαιώματος του Δημοσίου προς έλεγχο.
στο 