Σε 57.556 ανέρχονται οι πρόσφυγες σε όλη τη χώρα σήμερα, σύμφωνα με το Συντονιστικό Όργανο Διαχείρισης της Προσφυγικής Κρίσης. Στη βόρεια Ελλάδα φιλοξενούνται 23.295 πρόσφυγες, στην κεντρική Ελλάδα 2.011 και στη νότια Ελλάδα 252. Στην Αττική διαμένουν 10.463 πρόσφυγες στις οργανωμένες δομές φιλοξενίας και 4.423 σε Ελληνικό και Πειραιά. Επίσης, 6.894 πρόσφυγες φιλοξενούνται στις δομές που διαχειρίζεται η Ύπατη Αρμοστεία του ΟΗΕ για τους πρόσφυγες, ενώ εκτιμάται ότι 1.500 άτομα βρίσκονται εκτός δομών φιλοξενίας. Οι νέες αφίξεις στα νησιά, το τελευταίο 24ωρο ανήλθαν σε 63, ενώ συνολικά στα νησιά βρίσκονται 8.718 άτομα.
Εξάλλου, σύμφωνα με στοιχεία της Frontex, ο αριθμός των μεταναστών που ακολούθησαν τη διαδρομή της ανατολικής Μεσογείου και είχαν κυριότερο προορισμό άφιξης την Ελλάδα, ανήλθε τον Ιούνιο στους 1.450, καταγράφοντας πτώση 95% σε σχέση με τον Ιούνιο του 2015. Οι Σύροι συνέχισαν να αντιπροσωπεύουν το μεγαλύτερο μερίδιο των αφίξεων στην Ελλάδα και ακολούθησαν οι Πακιστανοί, οι Αφγανοί και οι Ιρακινοί.
Αντίθετα, οι μεταναστευτικές ροές στην κεντρική Μεσόγειο παρέμειναν υψηλές τον Ιούνιο, με τον αριθμό των μεταναστών που έφτασαν στην Ιταλία τον προηγούμενο μήνα να είναι αυξημένος κατά 24% σε σχέση με τον Μάιο του 2016. Πάντως, ο συνολικός αριθμός των αφίξεων στην Ιταλία το πρώτο εξάμηνο του 2016 ανήλθε σε 69.500 και εκτιμάται ότι είναι σε παρόμοια επίπεδα με τον αντίστοιχο αριθμό πριν από ένα χρόνο.