Ένα από τα πλέον συνηθισμένα προβλήματα που αντιμετωπίζουν οι δικαιούχοι, κυρίως συνταξιούχοι, κατά την είσοδό τους στο σύστημα, είναι η μη αντιστοίχιση του ΑΜΚΑ με το ΑΦΜ του δικαιούχου. Σε αυτή την περίπτωση η αίτηση δεν προχωρεί στο επόμενο στάδιο, με τους δικαιούχους να πρέπει να μεταβούν σε κάποιο ΚΕΠ προκειμένου να διευθετηθεί το πρόβλημα.
Χαρακτηριστική είναι η καταγγελία αναγνώστη του enikos.gr.
Όπως αναφέρει στην περίπτωση της μητέρας του υπήρχε αναντιστοιχία ανάμεσα στον ΑΜΚΑ και τον ΑΦΜ.Η ίδια πήγε στο ΚΕΠ για να κάνει τη διόρθωση ,αλλά δεν μπόρεσε να κάνει επανέλεγχο και η αίτηση ακυρώθηκε.